
博士は地図にない島を拠点にし、そこで発見したネオザルスにさまざまな怪獣の遺伝子を組み込み、最強の怪獣を作り上げた。しかし、ネオザルスには知性がないため、ハネジローの遺伝子を使って博士の命令をきくようにして、手始めに生物工学委員会を襲撃させようとしていたのだ。
博士は機械のスイッチを入れ、ハネジローの遺伝子を抽出しようとする。そこに、通信で状況を聞いていたアスカがα号で攻撃し機械を破壊した。それと同時に暴走したクローンシルバゴンが現れ、研究所を破壊。博士はネオザルスを目覚めさせ、クローンシルバゴンと戦わせた。ネオザルスはクローンシルバゴンを倒すと、攻撃の矛先を博士に向ける。博士はネオザルスに踏み潰されてしまうのだった。
ネオザルスはかわしても追尾してくる光線・ホーミングビームでアスカの乗ったガッツイーグル α号を撃墜。アスカはウルトラマンダイナに変身して戦いはじめるが、尻尾を使ったパワフルな攻撃に苦戦してしまう。そこでダイナはストロングタイプに変身して、反撃。ネオザルスのホーミングビームをネオザルス自身の尻尾で防御し、最後はガルネイトボンバー(シューティングバージョン)で撃破した。