
ケンゴが悪夢から目を覚ますと、出動命令がくだる。新たに超古代のものと思われる遺跡が発見されたのだ。現地に赴き、発見された出土品を眺めていたケンゴ。しかし、スタッフの中に、以前も対立した「宇宙一のトレジャーハンター」を名乗るイグニスが紛れていた。出土品の中から発光する謎の物体に目をつけたイグニスは、それを奪おうとするもシズマ ユナ隊員に気づかれ、出土品を置いて逃走する。
その後、出土品はGUTS-SELECTの拠点であるナースデッセイ号に搬入され、ヒジリ アキト隊員によって調査が行われることになる。しかし、アキトの研究室にイグニスが出現。さらに、地中から怪獣が現れる。